Gobiodon Okinawae raggiunge al massimo i 4 cm di lunghezza. Lo puoi distinguere con facilità dalle specie simili, perché ha una livrea quasi esclusivamente giallo accesso.

L’unica eccezione sono gli opercoli branchiali, che sono di una tonalità di giallo più chiara (tendente al rosa chiaro).

Il suo corpo è ricoperto da un muco epidermico tossico – usato come arma difensiva, per difendersi da eventuali predatori. Anche il gobbio di Okinawa è sprovvisto di vescica natatoria, come molte altre specie che si sono evolute in maniera simile